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MT-ND6 (TA71A) vs. MT-ND4L (AB71T)

Classic molecular dynamics






Essential molecular dynamics

TA71A
-336.7
305.04
AB71T
-266.5
223.0
WT
-190.5
246.89
TA71A-AB71T
-190.5
246.89



Analysis of inter-protein binding energy (H-bonds through the interface)

Legend: position:protein:residue(atom)-position:protein residue(atom)

AB71T
Donor-Acceptor Occupancy (%)
174 MT-ND6:ASN(D21) - 174 MT-ND6:ASN( O ) 10.0
174 MT-ND6:ASN( H ) - 83 MT-ND4L:ASN(OD1) 32.2
171 MT-ND6:ALA( H ) - 167 MT-ND6:VAL( O ) 94.0
170 MT-ND6:ILE( H ) - 166 MT-ND6:ILE( O ) 74.2
160 MT-ND6:LEU( H ) - 156 MT-ND6:THR( O ) 91.4
159 MT-ND6:THR(HG1) - 155 MT-ND6:VAL( O ) 97.8
159 MT-ND6:THR( H ) - 155 MT-ND6:VAL( O ) 85.8
156 MT-ND6:THR(HG1) - 152 MT-ND6:LEU( O ) 77.6
156 MT-ND6:THR( H ) - 152 MT-ND6:LEU( O ) 95.2
148 MT-ND6:TYR( H ) - 144 MT-ND6:ALA( O ) 53.8
144 MT-ND6:ALA( H ) - 140 MT-ND6:ILE( O ) 28.2
142 MT-ND6:ALA( H ) - 138 MT-ND6:ASP( O ) 75.2
140 MT-ND6:ILE( H ) - 137 MT-ND6:GLU( O ) 14.0
137 MT-ND6:GLU( H ) - 137 MT-ND6:GLU(OE1) 18.0
128 MT-ND6:GLU( H ) - 126 MT-ND6:ILE( O ) 20.8
119 MT-ND6:ASN(D21) - 117 MT-ND6:ASN( O ) 83.4
117 MT-ND6:ASN(D21) - 115 MT-ND6:VAL( O ) 42.2
117 MT-ND6:ASN(D21) - 114 MT-ND6:VAL( O ) 32.0
117 MT-ND6:ASN( H ) - 115 MT-ND6:VAL( O ) 36.2
106 MT-ND6:VAL( H ) - 102 MT-ND6:LEU( O ) 95.8
103 MT-ND6:VAL( H ) - 99 MT-ND6:GLU( O ) 88.4
102 MT-ND6:LEU( H ) - 98 MT-ND6:MET( O ) 94.8
98 MT-ND6:MET( H ) - 94 MT-ND6:VAL( O ) 88.6
74 MT-ND6:ALA( H ) - 71 MT-ND6:THR( O ) 17.6
74 MT-ND6:ALA( H ) - 70 MT-ND6:THR( O ) 30.2
71 MT-ND6:THR(HG1) - 67 MT-ND6:PHE( O ) 98.4
71 MT-ND6:THR( H ) - 67 MT-ND6:PHE( O ) 93.8
70 MT-ND6:THR(HG1) - 66 MT-ND6:VAL( O ) 58.8
70 MT-ND6:THR( H ) - 66 MT-ND6:VAL( O ) 98.4
67 MT-ND6:PHE( H ) - 63 MT-ND6:MET( O ) 93.6
64 MT-ND6:MET( H ) - 59 MT-ND6:TYR( O ) 96.0
63 MT-ND6:MET( H ) - 58 MT-ND6:ILE( O ) 95.2
60 MT-ND6:LEU( H ) - 55 MT-ND6:VAL( O ) 13.0
59 MT-ND6:TYR( H ) - 55 MT-ND6:VAL( O ) 87.2
58 MT-ND6:ILE( H ) - 54 MT-ND6:MET( O ) 87.8
55 MT-ND6:VAL( H ) - 51 MT-ND6:MET( O ) 91.6
54 MT-ND6:MET( H ) - 51 MT-ND6:MET( O ) 10.2
54 MT-ND6:MET( H ) - 50 MT-ND6:TYR( O ) 61.2
50 MT-ND6:TYR( H ) - 138 MT-ND6:ASP(OD2) 73.2
46 MT-ND6:PHE( H ) - 43 MT-ND6:ILE( O ) 72.2
24 MT-ND6:SER( H ) - 22 MT-ND6:LYS( O ) 63.2
22 MT-ND6:LYS(HZ1) - 23 MT-ND4L:ARG( O ) 38.2
22 MT-ND6:LYS( H ) - 19 MT-ND6:PHE( O ) 89.2
20 MT-ND6:SER(HG ) - 17 MT-ND6:VAL( O ) 54.6
20 MT-ND6:SER(HG ) - 16 MT-ND6:PHE( O ) 43.6
20 MT-ND6:SER( H ) - 17 MT-ND6:VAL( O ) 26.0
20 MT-ND6:SER( H ) - 16 MT-ND6:PHE( O ) 54.4
17 MT-ND6:VAL( H ) - 13 MT-ND6:VAL( O ) 99.4
16 MT-ND6:PHE( H ) - 12 MT-ND6:LEU( O ) 87.8
13 MT-ND6:VAL( H ) - 9 MT-ND6:SER( O ) 54.4
10 MT-ND6:VAL( H ) - 6 MT-ND6:PHE( O ) 95.2
9 MT-ND6:SER(HG ) - 5 MT-ND6:LEU( O ) 21.2
9 MT-ND6:SER( H ) - 5 MT-ND6:LEU( O ) 59.2
83 MT-ND4L:ASN( H ) - 79 MT-ND4L:VAL( O ) 92.2
82 MT-ND4L:SER(HG ) - 78 MT-ND4L:LEU( O ) 54.2
82 MT-ND4L:SER( H ) - 78 MT-ND4L:LEU( O ) 83.2
80 MT-ND4L:SER(HG ) - 76 MT-ND4L:ALA( O ) 41.8
80 MT-ND4L:SER( H ) - 76 MT-ND4L:ALA( O ) 78.0
79 MT-ND4L:VAL( H ) - 75 MT-ND4L:LEU( O ) 92.4
77 MT-ND4L:LEU( H ) - 73 MT-ND4L:VAL( O ) 86.6
76 MT-ND4L:ALA( H ) - 72 MT-ND4L:ALA( O ) 92.6
75 MT-ND4L:LEU( H ) - 71 MT-ND4L:ALA( O ) 91.4
73 MT-ND4L:VAL( H ) - 69 MT-ND4L:CYS( O ) 89.6
72 MT-ND4L:ALA( H ) - 68 MT-ND4L:ALA( O ) 74.0
71 MT-ND4L:ALA(HG1) - 67 MT-ND4L:ALA( O ) 88.4
71 MT-ND4L:ALA( H ) - 67 MT-ND4L:ALA( O ) 91.4
69 MT-ND4L:CYS( H ) - 65 MT-ND4L:VAL( O ) 78.8
68 MT-ND4L:ALA( H ) - 64 MT-ND4L:LEU( O ) 93.4
66 MT-ND4L:PHE( H ) - 62 MT-ND4L:VAL( O ) 88.4
65 MT-ND4L:VAL( H ) - 61 MT-ND4L:ILE( O ) 88.6
64 MT-ND4L:LEU( H ) - 60 MT-ND4L:PRO( O ) 68.4
62 MT-ND4L:VAL( H ) - 58 MT-ND4L:ILE( O ) 37.8
61 MT-ND4L:ILE( H ) - 58 MT-ND4L:ILE( O ) 19.6
59 MT-ND4L:MET( H ) - 55 MT-ND4L:LEU( O ) 93.4
58 MT-ND4L:ILE( H ) - 55 MT-ND4L:LEU( O ) 38.6
58 MT-ND4L:ILE( H ) - 54 MT-ND4L:LEU( O ) 29.8
57 MT-ND4L:ASN(D21) - 54 MT-ND4L:LEU( O ) 14.8
57 MT-ND4L:ASN( H ) - 54 MT-ND4L:LEU( O ) 54.2
52 MT-ND4L:HIS(HE2) - 126 MT-ND6:ILE( O ) 13.4
52 MT-ND4L:HIS( H ) - 49 MT-ND4L:LEU( O ) 73.8
50 MT-ND4L:ASN(D21) - 46 MT-ND4L:LEU( O ) 11.6
50 MT-ND4L:ASN( H ) - 46 MT-ND4L:LEU( O ) 48.0
49 MT-ND4L:LEU( H ) - 45 MT-ND4L:THR( O ) 94.6
48 MT-ND4L:THR(HG1) - 45 MT-ND4L:THR( O ) 11.8
48 MT-ND4L:THR( H ) - 45 MT-ND4L:THR( O ) 24.4
46 MT-ND4L:LEU( H ) - 42 MT-ND4L:ILE( O ) 97.6
45 MT-ND4L:THR(HG1) - 41 MT-ND4L:PHE( O ) 98.4
45 MT-ND4L:THR( H ) - 41 MT-ND4L:PHE( O ) 95.2
42 MT-ND4L:ILE( H ) - 38 MT-ND4L:LEU( O ) 95.8
41 MT-ND4L:PHE( H ) - 37 MT-ND4L:MET( O ) 92.8
38 MT-ND4L:LEU( H ) - 34 MT-ND4L:GLU( O ) 92.0
34 MT-ND4L:GLU( H ) - 30 MT-ND4L:LEU( O ) 81.6
32 MT-ND4L:CYS( H ) - 29 MT-ND4L:SER( O ) 19.6
32 MT-ND4L:CYS( H ) - 28 MT-ND4L:SER( O ) 16.4
31 MT-ND4L:LEU( H ) - 28 MT-ND4L:SER( O ) 14.8
31 MT-ND4L:LEU( H ) - 27 MT-ND4L:MET( O ) 47.4
30 MT-ND4L:LEU( H ) - 27 MT-ND4L:MET( O ) 23.4
29 MT-ND4L:SER(HG ) - 22 MT-ND6:LYS(NZ ) 37.4
29 MT-ND4L:SER( H ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 18.8
28 MT-ND4L:SER(HG ) - 22 MT-ND6:LYS(NZ ) 37.8
28 MT-ND4L:SER(HG ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 60.0
28 MT-ND4L:SER( H ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 42.6
28 MT-ND4L:SER( H ) - 25 MT-ND4L:HIS(ND1) 20.4
27 MT-ND4L:MET( H ) - 25 MT-ND4L:HIS(ND1) 31.8
24 MT-ND4L:SER(HG ) - 25 MT-ND4L:HIS( N ) 25.8
23 MT-ND4L:ARG(H21) - 87 MT-ND6:GLU(OE2) 37.2
23 MT-ND4L:ARG(H21) - 87 MT-ND6:GLU(OE1) 45.4
23 MT-ND4L:ARG(H11) - 87 MT-ND6:GLU(OE2) 43.2
23 MT-ND4L:ARG(H11) - 87 MT-ND6:GLU(OE1) 37.6
21 MT-ND4L:VAL( H ) - 17 MT-ND4L:LEU( O ) 88.2
17 MT-ND4L:LEU( H ) - 13 MT-ND4L:THR( O ) 98.4
15 MT-ND4L:SER(HG ) - 11 MT-ND4L:ALA( O ) 90.8
15 MT-ND4L:SER( H ) - 11 MT-ND4L:ALA( O ) 78.8
14 MT-ND4L:ILE( H ) - 10 MT-ND4L:LEU( O ) 99.2
11 MT-ND4L:ALA( H ) - 7 MT-ND4L:ASN( O ) 96.4
10 MT-ND4L:LEU( H ) - 6 MT-ND4L:MET( O ) 89.2
8 MT-ND4L:ILE( H ) - 4 MT-ND4L:ILE( O ) 86.4
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 99 MT-ND6:GLU(OE2) 48.4
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 99 MT-ND6:GLU(OE1) 65.8
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 9 MT-ND6:SER( O ) 79.8
7 MT-ND4L:ASN( H ) - 3 MT-ND4L:LEU( O ) 76.0
6 MT-ND4L:MET( H ) - 2 MT-ND4L:PRO( O ) 90.8
5 MT-ND4L:TYR( H ) - 1 MT-ND4L:MET( O ) 51.2
4 MT-ND4L:ILE( H ) - 1 MT-ND4L:MET( O ) 30.4
TA71A
Donor-Acceptor Occupancy (%)
174 MT-ND6:ASN( H ) - 171 MT-ND6:ALA( O ) 52.0
171 MT-ND6:ALA( H ) - 167 MT-ND6:VAL( O ) 95.2
170 MT-ND6:ILE( H ) - 166 MT-ND6:ILE( O ) 86.8
160 MT-ND6:LEU( H ) - 156 MT-ND6:THR( O ) 90.8
159 MT-ND6:THR(HG1) - 156 MT-ND6:THR( O ) 14.8
159 MT-ND6:THR(HG1) - 155 MT-ND6:VAL( O ) 69.8
159 MT-ND6:THR( H ) - 155 MT-ND6:VAL( O ) 89.6
156 MT-ND6:THR(HG1) - 152 MT-ND6:LEU( O ) 74.6
156 MT-ND6:THR( H ) - 152 MT-ND6:LEU( O ) 81.0
155 MT-ND6:VAL( H ) - 152 MT-ND6:LEU( O ) 10.4
148 MT-ND6:TYR( H ) - 144 MT-ND6:ALA( O ) 66.4
144 MT-ND6:ALA( H ) - 140 MT-ND6:ILE( O ) 83.0
142 MT-ND6:ALA( H ) - 138 MT-ND6:ASP( O ) 57.4
140 MT-ND6:ILE( H ) - 137 MT-ND6:GLU( O ) 48.2
137 MT-ND6:GLU( H ) - 137 MT-ND6:GLU(OE1) 11.4
128 MT-ND6:GLU( H ) - 126 MT-ND6:ILE( O ) 27.6
119 MT-ND6:ASN( H ) - 117 MT-ND6:ASN( O ) 15.4
117 MT-ND6:ASN(D21) - 106 MT-ND6:VAL( O ) 30.2
117 MT-ND6:ASN( H ) - 115 MT-ND6:VAL( O ) 52.0
106 MT-ND6:VAL( H ) - 102 MT-ND6:LEU( O ) 96.4
105 MT-ND6:TRP( H ) - 102 MT-ND6:LEU( O ) 17.4
103 MT-ND6:VAL( H ) - 99 MT-ND6:GLU( O ) 70.2
102 MT-ND6:LEU( H ) - 98 MT-ND6:MET( O ) 74.4
98 MT-ND6:MET( H ) - 94 MT-ND6:VAL( O ) 41.0
74 MT-ND6:ALA( H ) - 71 MT-ND6:THR( O ) 37.2
74 MT-ND6:ALA( H ) - 70 MT-ND6:THR( O ) 43.2
73 MT-ND6:MET( H ) - 70 MT-ND6:THR( O ) 20.8
71 MT-ND6:THR( H ) - 67 MT-ND6:PHE( O ) 92.2
70 MT-ND6:THR(HG1) - 66 MT-ND6:VAL( O ) 95.8
70 MT-ND6:THR( H ) - 66 MT-ND6:VAL( O ) 90.6
67 MT-ND6:PHE( H ) - 63 MT-ND6:MET( O ) 92.2
64 MT-ND6:MET( H ) - 59 MT-ND6:TYR( O ) 97.4
63 MT-ND6:MET( H ) - 59 MT-ND6:TYR( O ) 14.4
63 MT-ND6:MET( H ) - 58 MT-ND6:ILE( O ) 38.2
60 MT-ND6:LEU( H ) - 55 MT-ND6:VAL( O ) 87.6
59 MT-ND6:TYR(HH ) - 34 MT-ND4L:GLU(OE2) 23.2
59 MT-ND6:TYR(HH ) - 34 MT-ND4L:GLU(OE1) 61.8
59 MT-ND6:TYR( H ) - 55 MT-ND6:VAL( O ) 52.8
58 MT-ND6:ILE( H ) - 54 MT-ND6:MET( O ) 95.6
55 MT-ND6:VAL( H ) - 51 MT-ND6:MET( O ) 94.4
54 MT-ND6:MET( H ) - 50 MT-ND6:TYR( O ) 94.0
50 MT-ND6:TYR( H ) - 138 MT-ND6:ASP(OD2) 20.6
46 MT-ND6:PHE( H ) - 43 MT-ND6:ILE( O ) 20.8
46 MT-ND6:PHE( H ) - 42 MT-ND6:ILE( O ) 60.2
24 MT-ND6:SER(HG ) - 80 MT-ND6:GLU(OE1) 17.0
24 MT-ND6:SER( H ) - 22 MT-ND6:LYS( O ) 79.8
22 MT-ND6:LYS(HZ1) - 23 MT-ND4L:ARG( O ) 34.2
22 MT-ND6:LYS( H ) - 19 MT-ND6:PHE( O ) 93.2
20 MT-ND6:SER(HG ) - 16 MT-ND6:PHE( O ) 67.6
20 MT-ND6:SER(HG ) - 14 MT-ND4L:ILE( O ) 22.8
20 MT-ND6:SER( H ) - 16 MT-ND6:PHE( O ) 95.2
17 MT-ND6:VAL( H ) - 13 MT-ND6:VAL( O ) 97.2
16 MT-ND6:PHE( H ) - 12 MT-ND6:LEU( O ) 97.0
13 MT-ND6:VAL( H ) - 9 MT-ND6:SER( O ) 81.8
10 MT-ND6:VAL( H ) - 6 MT-ND6:PHE( O ) 89.8
9 MT-ND6:SER(HG ) - 5 MT-ND6:LEU( O ) 77.8
9 MT-ND6:SER(HG ) - 7 MT-ND4L:ASN(OD1) 12.0
9 MT-ND6:SER( H ) - 5 MT-ND6:LEU( O ) 62.8
83 MT-ND4L:ASN(D21) - 174 MT-ND6:ASN(OD1) 86.4
83 MT-ND4L:ASN(D21) - 79 MT-ND4L:VAL( O ) 33.4
83 MT-ND4L:ASN( H ) - 79 MT-ND4L:VAL( O ) 86.2
82 MT-ND4L:SER(HG ) - 79 MT-ND4L:VAL( O ) 32.2
82 MT-ND4L:SER(HG ) - 78 MT-ND4L:LEU( O ) 35.6
82 MT-ND4L:SER( H ) - 78 MT-ND4L:LEU( O ) 88.4
80 MT-ND4L:SER( H ) - 76 MT-ND4L:ALA( O ) 58.6
79 MT-ND4L:VAL( H ) - 76 MT-ND4L:ALA( O ) 33.6
79 MT-ND4L:VAL( H ) - 75 MT-ND4L:LEU( O ) 57.0
78 MT-ND4L:LEU( H ) - 75 MT-ND4L:LEU( O ) 25.6
77 MT-ND4L:LEU( H ) - 73 MT-ND4L:VAL( O ) 87.6
76 MT-ND4L:ALA( H ) - 72 MT-ND4L:ALA( O ) 84.0
75 MT-ND4L:LEU( H ) - 71 MT-ND4L:ALA( O ) 80.6
73 MT-ND4L:VAL( H ) - 69 MT-ND4L:CYS( O ) 84.4
72 MT-ND4L:ALA( H ) - 68 MT-ND4L:ALA( O ) 85.2
71 MT-ND4L:ALA( H ) - 67 MT-ND4L:ALA( O ) 89.8
69 MT-ND4L:CYS( H ) - 65 MT-ND4L:VAL( O ) 85.2
68 MT-ND4L:ALA( H ) - 64 MT-ND4L:LEU( O ) 88.6
66 MT-ND4L:PHE( H ) - 62 MT-ND4L:VAL( O ) 75.0
65 MT-ND4L:VAL( H ) - 61 MT-ND4L:ILE( O ) 73.2
64 MT-ND4L:LEU( H ) - 60 MT-ND4L:PRO( O ) 79.2
62 MT-ND4L:VAL( H ) - 58 MT-ND4L:ILE( O ) 59.2
61 MT-ND4L:ILE( H ) - 58 MT-ND4L:ILE( O ) 43.2
59 MT-ND4L:MET( H ) - 55 MT-ND4L:LEU( O ) 41.6
58 MT-ND4L:ILE( H ) - 55 MT-ND4L:LEU( O ) 44.2
58 MT-ND4L:ILE( H ) - 54 MT-ND4L:LEU( O ) 27.2
57 MT-ND4L:ASN(D21) - 48 MT-ND4L:THR( O ) 55.8
57 MT-ND4L:ASN( H ) - 54 MT-ND4L:LEU( O ) 17.8
52 MT-ND4L:HIS(HE2) - 125 MT-ND6:MET( O ) 23.2
52 MT-ND4L:HIS( H ) - 49 MT-ND4L:LEU( O ) 50.2
52 MT-ND4L:HIS( H ) - 48 MT-ND4L:THR( O ) 18.8
50 MT-ND4L:ASN( H ) - 46 MT-ND4L:LEU( O ) 51.2
49 MT-ND4L:LEU( H ) - 45 MT-ND4L:THR( O ) 98.2
48 MT-ND4L:THR(HG1) - 57 MT-ND4L:ASN(OD1) 65.0
46 MT-ND4L:LEU( H ) - 42 MT-ND4L:ILE( O ) 95.8
45 MT-ND4L:THR(HG1) - 41 MT-ND4L:PHE( O ) 87.2
45 MT-ND4L:THR( H ) - 41 MT-ND4L:PHE( O ) 95.0
42 MT-ND4L:ILE( H ) - 38 MT-ND4L:LEU( O ) 95.2
41 MT-ND4L:PHE( H ) - 37 MT-ND4L:MET( O ) 91.6
38 MT-ND4L:LEU( H ) - 34 MT-ND4L:GLU( O ) 97.2
34 MT-ND4L:GLU( H ) - 30 MT-ND4L:LEU( O ) 93.0
32 MT-ND4L:CYS( H ) - 29 MT-ND4L:SER( O ) 23.2
32 MT-ND4L:CYS( H ) - 28 MT-ND4L:SER( O ) 23.8
31 MT-ND4L:LEU( H ) - 28 MT-ND4L:SER( O ) 22.2
31 MT-ND4L:LEU( H ) - 27 MT-ND4L:MET( O ) 40.8
30 MT-ND4L:LEU( H ) - 27 MT-ND4L:MET( O ) 11.4
29 MT-ND4L:SER(HG ) - 22 MT-ND6:LYS(NZ ) 20.2
29 MT-ND4L:SER(HG ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 21.4
29 MT-ND4L:SER( H ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 31.0
28 MT-ND4L:SER(HG ) - 22 MT-ND6:LYS(NZ ) 37.6
28 MT-ND4L:SER(HG ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 67.6
28 MT-ND4L:SER( H ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 38.2
28 MT-ND4L:SER( H ) - 25 MT-ND4L:HIS(ND1) 33.2
27 MT-ND4L:MET( H ) - 25 MT-ND4L:HIS(ND1) 19.6
25 MT-ND4L:HIS(HE2) - 74 MT-ND6:ALA( O ) 16.4
24 MT-ND4L:SER(HG ) - 25 MT-ND4L:HIS( N ) 11.8
23 MT-ND4L:ARG(H21) - 80 MT-ND6:GLU(OE2) 32.6
23 MT-ND4L:ARG(H21) - 80 MT-ND6:GLU(OE1) 43.4
23 MT-ND4L:ARG(H11) - 80 MT-ND6:GLU(OE2) 32.2
23 MT-ND4L:ARG(H11) - 80 MT-ND6:GLU(OE1) 25.0
21 MT-ND4L:VAL( H ) - 17 MT-ND4L:LEU( O ) 31.6
17 MT-ND4L:LEU( H ) - 13 MT-ND4L:THR( O ) 96.0
15 MT-ND4L:SER(HG ) - 32 MT-ND4L:CYS( O ) 40.0
15 MT-ND4L:SER(HG ) - 11 MT-ND4L:ALA( O ) 32.0
15 MT-ND4L:SER( H ) - 11 MT-ND4L:ALA( O ) 83.8
14 MT-ND4L:ILE( H ) - 10 MT-ND4L:LEU( O ) 97.4
13 MT-ND4L:THR(HG1) - 10 MT-ND4L:LEU( O ) 21.2
11 MT-ND4L:ALA( H ) - 7 MT-ND4L:ASN( O ) 93.8
10 MT-ND4L:LEU( H ) - 6 MT-ND4L:MET( O ) 90.0
8 MT-ND4L:ILE( H ) - 4 MT-ND4L:ILE( O ) 85.0
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 99 MT-ND6:GLU(OE2) 18.0
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 9 MT-ND6:SER( O ) 11.8
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 3 MT-ND4L:LEU( O ) 30.4
7 MT-ND4L:ASN( H ) - 3 MT-ND4L:LEU( O ) 58.8
6 MT-ND4L:MET( H ) - 3 MT-ND4L:LEU( O ) 13.0
6 MT-ND4L:MET( H ) - 2 MT-ND4L:PRO( O ) 71.6
5 MT-ND4L:TYR( H ) - 1 MT-ND4L:MET( O ) 52.4
4 MT-ND4L:ILE( H ) - 1 MT-ND4L:MET( O ) 14.2
WT
Donor-Acceptor Occupancy (%)
174 MT-ND6:ASN(D21) - 174 MT-ND6:ASN(OXT) 10.0
171 MT-ND6:ALA( H ) - 167 MT-ND6:VAL( O ) 49.0
171 MT-ND6:ALA( H ) - 166 MT-ND6:ILE( O ) 40.4
170 MT-ND6:ILE( H ) - 166 MT-ND6:ILE( O ) 53.6
160 MT-ND6:LEU( H ) - 156 MT-ND6:THR( O ) 91.8
159 MT-ND6:THR(HG1) - 155 MT-ND6:VAL( O ) 90.8
159 MT-ND6:THR( H ) - 155 MT-ND6:VAL( O ) 93.6
156 MT-ND6:THR(HG1) - 152 MT-ND6:LEU( O ) 98.8
156 MT-ND6:THR( H ) - 152 MT-ND6:LEU( O ) 91.2
152 MT-ND6:LEU( H ) - 148 MT-ND6:TYR( O ) 34.4
148 MT-ND6:TYR( H ) - 145 MT-ND6:LEU( O ) 12.6
148 MT-ND6:TYR( H ) - 144 MT-ND6:ALA( O ) 67.8
145 MT-ND6:LEU( H ) - 142 MT-ND6:ALA( O ) 65.0
144 MT-ND6:ALA( H ) - 140 MT-ND6:ILE( O ) 27.0
142 MT-ND6:ALA( H ) - 138 MT-ND6:ASP( O ) 89.0
140 MT-ND6:ILE( H ) - 137 MT-ND6:GLU( O ) 56.2
137 MT-ND6:GLU( H ) - 137 MT-ND6:GLU(OE2) 19.0
137 MT-ND6:GLU( H ) - 137 MT-ND6:GLU(OE1) 15.0
128 MT-ND6:GLU( H ) - 126 MT-ND6:ILE( O ) 20.4
127 MT-ND6:TYR(HH ) - 117 MT-ND6:ASN(OD1) 34.8
119 MT-ND6:ASN( H ) - 117 MT-ND6:ASN(OD1) 27.6
106 MT-ND6:VAL( H ) - 102 MT-ND6:LEU( O ) 93.8
103 MT-ND6:VAL( H ) - 99 MT-ND6:GLU( O ) 97.2
102 MT-ND6:LEU( H ) - 98 MT-ND6:MET( O ) 74.0
98 MT-ND6:MET( H ) - 94 MT-ND6:VAL( O ) 43.2
74 MT-ND6:ALA( H ) - 71 MT-ND6:THR( O ) 86.0
73 MT-ND6:MET( H ) - 70 MT-ND6:THR( O ) 58.8
71 MT-ND6:THR(HG1) - 67 MT-ND6:PHE( O ) 93.2
71 MT-ND6:THR( H ) - 67 MT-ND6:PHE( O ) 93.4
70 MT-ND6:THR(HG1) - 66 MT-ND6:VAL( O ) 25.0
70 MT-ND6:THR(HG1) - 71 MT-ND4L:ALA( O ) 69.4
70 MT-ND6:THR( H ) - 66 MT-ND6:VAL( O ) 91.2
67 MT-ND6:PHE( H ) - 63 MT-ND6:MET( O ) 98.6
64 MT-ND6:MET( H ) - 59 MT-ND6:TYR( O ) 97.4
63 MT-ND6:MET( H ) - 58 MT-ND6:ILE( O ) 98.6
60 MT-ND6:LEU( H ) - 55 MT-ND6:VAL( O ) 91.8
59 MT-ND6:TYR(HH ) - 34 MT-ND4L:GLU( O ) 71.0
59 MT-ND6:TYR(HH ) - 34 MT-ND4L:GLU(OE1) 26.0
59 MT-ND6:TYR( H ) - 55 MT-ND6:VAL( O ) 11.2
59 MT-ND6:TYR( H ) - 54 MT-ND6:MET( O ) 51.2
58 MT-ND6:ILE( H ) - 54 MT-ND6:MET( O ) 80.0
55 MT-ND6:VAL( H ) - 51 MT-ND6:MET( O ) 77.8
54 MT-ND6:MET( H ) - 51 MT-ND6:MET( O ) 13.4
54 MT-ND6:MET( H ) - 50 MT-ND6:TYR( O ) 32.0
46 MT-ND6:PHE( H ) - 42 MT-ND6:ILE( O ) 76.4
24 MT-ND6:SER( H ) - 22 MT-ND6:LYS( O ) 25.2
22 MT-ND6:LYS(HZ1) - 20 MT-ND6:SER( O ) 17.4
22 MT-ND6:LYS(HZ1) - 23 MT-ND4L:ARG( O ) 11.2
22 MT-ND6:LYS( H ) - 19 MT-ND6:PHE( O ) 64.0
20 MT-ND6:SER(HG ) - 16 MT-ND6:PHE( O ) 72.6
20 MT-ND6:SER(HG ) - 14 MT-ND4L:ILE( O ) 23.4
20 MT-ND6:SER( H ) - 16 MT-ND6:PHE( O ) 94.8
17 MT-ND6:VAL( H ) - 13 MT-ND6:VAL( O ) 94.2
16 MT-ND6:PHE( H ) - 12 MT-ND6:LEU( O ) 98.0
13 MT-ND6:VAL( H ) - 9 MT-ND6:SER( O ) 96.8
10 MT-ND6:VAL( H ) - 6 MT-ND6:PHE( O ) 97.0
9 MT-ND6:SER(HG ) - 99 MT-ND6:GLU(OE1) 99.8
9 MT-ND6:SER( H ) - 5 MT-ND6:LEU( O ) 46.4
89 MT-ND4L:TYR( H ) - 87 MT-ND4L:LEU( O ) 53.6
83 MT-ND4L:ASN(D21) - 73 MT-ND6:MET( O ) 43.0
83 MT-ND4L:ASN(D21) - 79 MT-ND4L:VAL( O ) 24.2
83 MT-ND4L:ASN( H ) - 80 MT-ND4L:SER( O ) 21.6
83 MT-ND4L:ASN( H ) - 79 MT-ND4L:VAL( O ) 64.0
82 MT-ND4L:SER(HG ) - 78 MT-ND4L:LEU( O ) 95.2
82 MT-ND4L:SER( H ) - 78 MT-ND4L:LEU( O ) 93.2
80 MT-ND4L:SER( H ) - 76 MT-ND4L:ALA( O ) 91.4
79 MT-ND4L:VAL( H ) - 75 MT-ND4L:LEU( O ) 83.0
77 MT-ND4L:LEU( H ) - 73 MT-ND4L:VAL( O ) 83.4
72 MT-ND4L:ALA( H ) - 69 MT-ND4L:CYS( O ) 85.2
71 MT-ND4L:ALA( H ) - 68 MT-ND4L:ALA( O ) 11.4
71 MT-ND4L:ALA( H ) - 67 MT-ND4L:ALA( O ) 63.8
69 MT-ND4L:CYS( H ) - 65 MT-ND4L:VAL( O ) 80.0
68 MT-ND4L:ALA( H ) - 64 MT-ND4L:LEU( O ) 80.6
66 MT-ND4L:PHE( H ) - 62 MT-ND4L:VAL( O ) 97.4
65 MT-ND4L:VAL( H ) - 61 MT-ND4L:ILE( O ) 76.8
64 MT-ND4L:LEU( H ) - 61 MT-ND4L:ILE( O ) 11.2
64 MT-ND4L:LEU( H ) - 60 MT-ND4L:PRO( O ) 47.6
62 MT-ND4L:VAL( H ) - 58 MT-ND4L:ILE( O ) 97.8
61 MT-ND4L:ILE( H ) - 58 MT-ND4L:ILE( O ) 10.2
58 MT-ND4L:ILE( H ) - 55 MT-ND4L:LEU( O ) 83.4
57 MT-ND4L:ASN(D21) - 138 MT-ND6:ASP(OD2) 16.8
57 MT-ND4L:ASN(D21) - 54 MT-ND4L:LEU( O ) 76.8
57 MT-ND4L:ASN( H ) - 54 MT-ND4L:LEU( O ) 59.4
52 MT-ND4L:HIS(HE2) - 128 MT-ND6:GLU(OE2) 14.6
52 MT-ND4L:HIS(HE2) - 128 MT-ND6:GLU(OE1) 18.4
52 MT-ND4L:HIS( H ) - 49 MT-ND4L:LEU( O ) 11.0
52 MT-ND4L:HIS( H ) - 48 MT-ND4L:THR( O ) 43.6
50 MT-ND4L:ASN(D21) - 46 MT-ND4L:LEU( O ) 53.8
50 MT-ND4L:ASN( H ) - 46 MT-ND4L:LEU( O ) 45.8
49 MT-ND4L:LEU( H ) - 45 MT-ND4L:THR( O ) 20.2
46 MT-ND4L:LEU( H ) - 42 MT-ND4L:ILE( O ) 80.6
45 MT-ND4L:THR(HG1) - 41 MT-ND4L:PHE( O ) 92.4
45 MT-ND4L:THR( H ) - 41 MT-ND4L:PHE( O ) 88.8
42 MT-ND4L:ILE( H ) - 38 MT-ND4L:LEU( O ) 97.8
41 MT-ND4L:PHE( H ) - 37 MT-ND4L:MET( O ) 90.0
38 MT-ND4L:LEU( H ) - 34 MT-ND4L:GLU( O ) 58.8
34 MT-ND4L:GLU( H ) - 31 MT-ND4L:LEU( O ) 48.6
32 MT-ND4L:CYS( H ) - 29 MT-ND4L:SER( O ) 73.0
31 MT-ND4L:LEU( H ) - 27 MT-ND4L:MET( O ) 75.6
29 MT-ND4L:SER(HG ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 41.4
29 MT-ND4L:SER( H ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 38.0
28 MT-ND4L:SER(HG ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 41.8
28 MT-ND4L:SER( H ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 29.6
27 MT-ND4L:MET( H ) - 25 MT-ND4L:HIS(ND1) 46.6
25 MT-ND4L:HIS( H ) - 23 MT-ND4L:ARG( O ) 10.2
24 MT-ND4L:SER(HG ) - 28 MT-ND4L:SER(OG ) 20.6
24 MT-ND4L:SER(HG ) - 25 MT-ND4L:HIS( N ) 11.8
24 MT-ND4L:SER(HG ) - 23 MT-ND4L:ARG( O ) 34.2
23 MT-ND4L:ARG(H21) - 87 MT-ND6:GLU(OE2) 49.8
23 MT-ND4L:ARG(H21) - 87 MT-ND6:GLU(OE1) 52.8
23 MT-ND4L:ARG(H11) - 87 MT-ND6:GLU(OE2) 41.8
23 MT-ND4L:ARG(H11) - 87 MT-ND6:GLU(OE1) 40.4
21 MT-ND4L:VAL( H ) - 17 MT-ND4L:LEU( O ) 36.4
17 MT-ND4L:LEU( H ) - 13 MT-ND4L:THR( O ) 97.4
15 MT-ND4L:SER(HG ) - 11 MT-ND4L:ALA( O ) 79.4
15 MT-ND4L:SER( H ) - 11 MT-ND4L:ALA( O ) 88.2
14 MT-ND4L:ILE( H ) - 10 MT-ND4L:LEU( O ) 98.6
11 MT-ND4L:ALA( H ) - 7 MT-ND4L:ASN( O ) 92.0
10 MT-ND4L:LEU( H ) - 7 MT-ND4L:ASN( O ) 10.8
10 MT-ND4L:LEU( H ) - 6 MT-ND4L:MET( O ) 70.4
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 99 MT-ND6:GLU(OE2) 99.8
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 9 MT-ND6:SER( O ) 84.6
6 MT-ND4L:MET( H ) - 3 MT-ND4L:LEU( O ) 75.6
5 MT-ND4L:TYR( H ) - 2 MT-ND4L:PRO( O ) 66.2
4 MT-ND4L:ILE( H ) - 1 MT-ND4L:MET( O ) 56.4
1 MT-ND4L:MET(H1 ) - 50 MT-ND4L:ASN(OD1) 10.0
TA71A-AB71T
Donor-Acceptor Occupancy (%)
174 MT-ND6:ASN(D21) - 174 MT-ND6:ASN(OXT) 18.4
171 MT-ND6:ALA( H ) - 167 MT-ND6:VAL( O ) 95.2
170 MT-ND6:ILE( H ) - 166 MT-ND6:ILE( O ) 93.4
160 MT-ND6:LEU( H ) - 156 MT-ND6:THR( O ) 91.0
159 MT-ND6:THR(HG1) - 155 MT-ND6:VAL( O ) 96.4
159 MT-ND6:THR( H ) - 155 MT-ND6:VAL( O ) 89.6
156 MT-ND6:THR(HG1) - 152 MT-ND6:LEU( O ) 91.0
156 MT-ND6:THR( H ) - 152 MT-ND6:LEU( O ) 98.8
148 MT-ND6:TYR( H ) - 144 MT-ND6:ALA( O ) 90.8
142 MT-ND6:ALA( H ) - 138 MT-ND6:ASP( O ) 85.0
140 MT-ND6:ILE( H ) - 137 MT-ND6:GLU( O ) 62.8
128 MT-ND6:GLU( H ) - 126 MT-ND6:ILE( O ) 22.8
127 MT-ND6:TYR(HH ) - 119 MT-ND6:ASN(OD1) 22.0
119 MT-ND6:ASN( H ) - 117 MT-ND6:ASN( O ) 17.0
117 MT-ND6:ASN(D21) - 115 MT-ND6:VAL( O ) 46.6
117 MT-ND6:ASN( H ) - 115 MT-ND6:VAL( O ) 51.2
106 MT-ND6:VAL( H ) - 102 MT-ND6:LEU( O ) 79.6
103 MT-ND6:VAL( H ) - 99 MT-ND6:GLU( O ) 88.6
102 MT-ND6:LEU( H ) - 98 MT-ND6:MET( O ) 94.0
98 MT-ND6:MET( H ) - 94 MT-ND6:VAL( O ) 84.2
87 MT-ND6:GLU( H ) - 87 MT-ND6:GLU(OE2) 26.8
87 MT-ND6:GLU( H ) - 87 MT-ND6:GLU(OE1) 36.6
74 MT-ND6:ALA( H ) - 71 MT-ND6:THR( O ) 59.4
74 MT-ND6:ALA( H ) - 70 MT-ND6:THR( O ) 13.2
73 MT-ND6:MET( H ) - 70 MT-ND6:THR( O ) 23.4
71 MT-ND6:THR( H ) - 67 MT-ND6:PHE( O ) 86.0
70 MT-ND6:THR(HG1) - 67 MT-ND6:PHE( O ) 10.6
70 MT-ND6:THR(HG1) - 66 MT-ND6:VAL( O ) 77.6
70 MT-ND6:THR( H ) - 66 MT-ND6:VAL( O ) 92.2
67 MT-ND6:PHE( H ) - 63 MT-ND6:MET( O ) 97.2
64 MT-ND6:MET( H ) - 59 MT-ND6:TYR( O ) 74.8
63 MT-ND6:MET( H ) - 58 MT-ND6:ILE( O ) 93.6
60 MT-ND6:LEU( H ) - 55 MT-ND6:VAL( O ) 31.8
59 MT-ND6:TYR(HH ) - 34 MT-ND4L:GLU(OE2) 55.8
59 MT-ND6:TYR(HH ) - 34 MT-ND4L:GLU(OE1) 34.0
59 MT-ND6:TYR( H ) - 55 MT-ND6:VAL( O ) 65.0
58 MT-ND6:ILE( H ) - 54 MT-ND6:MET( O ) 90.8
55 MT-ND6:VAL( H ) - 51 MT-ND6:MET( O ) 89.8
54 MT-ND6:MET( H ) - 50 MT-ND6:TYR( O ) 89.2
50 MT-ND6:TYR(HH ) - 57 MT-ND4L:ASN( O ) 16.8
50 MT-ND6:TYR( H ) - 138 MT-ND6:ASP(OD2) 23.0
46 MT-ND6:PHE( H ) - 43 MT-ND6:ILE( O ) 18.2
46 MT-ND6:PHE( H ) - 42 MT-ND6:ILE( O ) 52.4
22 MT-ND6:LYS(HZ1) - 28 MT-ND4L:SER( O ) 71.6
20 MT-ND6:SER(HG ) - 17 MT-ND6:VAL( O ) 70.6
20 MT-ND6:SER( H ) - 17 MT-ND6:VAL( O ) 69.6
19 MT-ND6:PHE( H ) - 16 MT-ND6:PHE( O ) 65.6
17 MT-ND6:VAL( H ) - 13 MT-ND6:VAL( O ) 79.0
16 MT-ND6:PHE( H ) - 13 MT-ND6:VAL( O ) 23.4
16 MT-ND6:PHE( H ) - 12 MT-ND6:LEU( O ) 30.4
13 MT-ND6:VAL( H ) - 9 MT-ND6:SER( O ) 71.6
12 MT-ND6:LEU( H ) - 9 MT-ND6:SER( O ) 12.0
10 MT-ND6:VAL( H ) - 6 MT-ND6:PHE( O ) 96.2
9 MT-ND6:SER(HG ) - 5 MT-ND6:LEU( O ) 78.0
9 MT-ND6:SER( H ) - 5 MT-ND6:LEU( O ) 74.0
89 MT-ND4L:TYR( H ) - 88 MT-ND4L:ASP(OD1) 47.0
83 MT-ND4L:ASN(D21) - 171 MT-ND6:ALA( O ) 76.0
83 MT-ND4L:ASN( H ) - 80 MT-ND4L:SER( O ) 54.2
83 MT-ND4L:ASN( H ) - 79 MT-ND4L:VAL( O ) 15.6
82 MT-ND4L:SER(HG ) - 78 MT-ND4L:LEU( O ) 84.6
82 MT-ND4L:SER( H ) - 78 MT-ND4L:LEU( O ) 86.0
80 MT-ND4L:SER(HG ) - 170 MT-ND6:ILE( O ) 41.2
80 MT-ND4L:SER(HG ) - 77 MT-ND4L:LEU( O ) 27.8
80 MT-ND4L:SER( H ) - 76 MT-ND4L:ALA( O ) 86.0
79 MT-ND4L:VAL( H ) - 75 MT-ND4L:LEU( O ) 86.4
77 MT-ND4L:LEU( H ) - 73 MT-ND4L:VAL( O ) 87.4
76 MT-ND4L:ALA( H ) - 72 MT-ND4L:ALA( O ) 90.8
75 MT-ND4L:LEU( H ) - 71 MT-ND4L:ALA( O ) 88.0
73 MT-ND4L:VAL( H ) - 68 MT-ND4L:ALA( O ) 62.8
71 MT-ND4L:ALA(HG1) - 34 MT-ND4L:GLU(OE1) 12.6
71 MT-ND4L:ALA( H ) - 67 MT-ND4L:ALA( O ) 99.2
69 MT-ND4L:CYS( H ) - 66 MT-ND4L:PHE( O ) 37.4
69 MT-ND4L:CYS( H ) - 65 MT-ND4L:VAL( O ) 18.8
68 MT-ND4L:ALA( H ) - 64 MT-ND4L:LEU( O ) 96.6
66 MT-ND4L:PHE( H ) - 62 MT-ND4L:VAL( O ) 69.8
65 MT-ND4L:VAL( H ) - 61 MT-ND4L:ILE( O ) 54.6
64 MT-ND4L:LEU( H ) - 60 MT-ND4L:PRO( O ) 63.2
62 MT-ND4L:VAL( H ) - 58 MT-ND4L:ILE( O ) 32.6
61 MT-ND4L:ILE( H ) - 58 MT-ND4L:ILE( O ) 19.8
58 MT-ND4L:ILE( H ) - 55 MT-ND4L:LEU( O ) 77.6
57 MT-ND4L:ASN(D21) - 54 MT-ND4L:LEU( O ) 73.4
57 MT-ND4L:ASN( H ) - 54 MT-ND4L:LEU( O ) 51.4
52 MT-ND4L:HIS( H ) - 49 MT-ND4L:LEU( O ) 78.0
50 MT-ND4L:ASN(D21) - 46 MT-ND4L:LEU( O ) 26.0
50 MT-ND4L:ASN( H ) - 46 MT-ND4L:LEU( O ) 66.0
49 MT-ND4L:LEU( H ) - 45 MT-ND4L:THR( O ) 82.6
46 MT-ND4L:LEU( H ) - 42 MT-ND4L:ILE( O ) 87.0
45 MT-ND4L:THR(HG1) - 41 MT-ND4L:PHE( O ) 93.4
45 MT-ND4L:THR( H ) - 41 MT-ND4L:PHE( O ) 97.4
42 MT-ND4L:ILE( H ) - 38 MT-ND4L:LEU( O ) 96.4
41 MT-ND4L:PHE( H ) - 37 MT-ND4L:MET( O ) 92.8
38 MT-ND4L:LEU( H ) - 34 MT-ND4L:GLU( O ) 99.4
34 MT-ND4L:GLU( H ) - 30 MT-ND4L:LEU( O ) 96.6
32 MT-ND4L:CYS( H ) - 29 MT-ND4L:SER( O ) 18.6
31 MT-ND4L:LEU( H ) - 27 MT-ND4L:MET( O ) 92.8
28 MT-ND4L:SER(HG ) - 22 MT-ND6:LYS(NZ ) 15.2
28 MT-ND4L:SER( H ) - 25 MT-ND4L:HIS( O ) 49.6
28 MT-ND4L:SER( H ) - 25 MT-ND4L:HIS(ND1) 22.4
24 MT-ND4L:SER(HG ) - 25 MT-ND4L:HIS( N ) 31.4
23 MT-ND4L:ARG( H ) - 21 MT-ND4L:VAL( O ) 33.0
17 MT-ND4L:LEU( H ) - 13 MT-ND4L:THR( O ) 95.6
15 MT-ND4L:SER(HG ) - 11 MT-ND4L:ALA( O ) 98.6
15 MT-ND4L:SER( H ) - 11 MT-ND4L:ALA( O ) 84.4
14 MT-ND4L:ILE( H ) - 10 MT-ND4L:LEU( O ) 96.2
11 MT-ND4L:ALA( H ) - 7 MT-ND4L:ASN( O ) 85.6
10 MT-ND4L:LEU( H ) - 6 MT-ND4L:MET( O ) 74.4
8 MT-ND4L:ILE( H ) - 4 MT-ND4L:ILE( O ) 27.8
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 99 MT-ND6:GLU(OE2) 43.2
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 99 MT-ND6:GLU(OE1) 43.4
7 MT-ND4L:ASN(D21) - 9 MT-ND6:SER( O ) 35.6
7 MT-ND4L:ASN( H ) - 3 MT-ND4L:LEU( O ) 23.0
6 MT-ND4L:MET( H ) - 3 MT-ND4L:LEU( O ) 57.4
6 MT-ND4L:MET( H ) - 2 MT-ND4L:PRO( O ) 14.4
5 MT-ND4L:TYR(HH ) - 50 MT-ND4L:ASN(ND2) 11.4
5 MT-ND4L:TYR( H ) - 2 MT-ND4L:PRO( O ) 44.6
4 MT-ND4L:ILE( H ) - 1 MT-ND4L:MET( O ) 74.2
1 MT-ND4L:MET(H1 ) - 125 MT-ND6:MET( O ) 17.8